Предыдущие поколения А6 комплектовались турбодизелями объемом 1.9, 2.5 и 3.0 литра мощностью от 90 до 239 л.с. На автомобилях 2015 года производитель оставил только одну дизельную «шестерку» — 3.0 TDI мощностью 245 л.с., которая считается самой надежной в нынешней линейке силовых агрегатов. Ее основные проблемы — износ или поломка турбокомпрессора, неисправности вихревых заслонок и системы EGR.
Прошлые моторы более «капризны». Из-за низкокачественной солярки часто выходят из строя насос-форсунки и ТНВД, а ГБЦ требует переборки из-за подвисших от нагара клапанов.